Die SCNAT konzentriert sich in ihrem Mehrjahresprogramm einerseits auf thematische Schwerpunkte zu den wichtigsten aktuellen Herausforderungen, welche die Lebensspanne mehrerer Generationen umfassen können: Ressourcen-Rohstoffe, Ernährung, Lebensraum Schweiz, Biodiversität, Klima, Energie, Genforschung sowie die Forschungszusammenarbeit Nord-Süd. Andererseits kommt den grundlegenden Kompetenzbereichen der SCNAT weiterhin grösste Bedeutung zu, etwa der Förderung des wissenschaftlichen Austauschs und der Vernetzung, der Nachwuchsförderung, der Kommunikation und Vermittlung von wissenschaftlichen Erkenntnissen etc..

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